艾玛是一名环境微生物学家,对矿业和农业部门的可持续发展充满热情。

艾玛于2010年在昆士兰大学(UQ)完成了微生物生态学博士学位,研究可用于减少牲畜温室气体排放的微生物。2010年至2012年间,她在德国雷根斯堡大学(University of Regensburg)研究海底沉积物中占主导地位的微生物。2013-2021年,艾玛在昆士兰大学从事地质微生物学研究,旨在了解和利用微生物过程,以加快矿区修复。

她的研究重点是在铁矿区重新形成地表结壳,解决煤矿恢复中的表土缺陷,以及与采矿业生物技术和环境可持续性相关的微生物-矿物相互作用。她还为采矿和农业部门提供环境微生物学咨询。艾玛目前是环境与科学部更好的康复团队的首席技术顾问,专注于矿坑康复。

研究

Emma的研究优势在于了解和利用微生物过程来提高采矿业和农业部门的生产力和可持续性,并将研究转化为现实世界的规模。有关刊物的名单可在此查阅:https://scholar.google.com.au/citations?user=_2HKLM0AAAAJ&hl=en

行业

Emma的地质微生物学研究已经得到了业界的高度关注,包括与淡水河谷公司(Vale)在巴西开展的加速铁矿现场修复的微生物技术试点示范。通过与必和必拓三菱联盟和澳大利亚煤炭协会研究项目的合作,她还领导了现场规模的研究,以解决昆士兰煤矿现场恢复期间的表土缺陷。艾玛为采矿、农业和生物技术公司提供咨询意见,这些公司希望利用微生物过程进行现场修复或改善可持续性,无论是在澳大利亚还是在国际上。

出版物

书部分
1.Gagen, E. J. Denman, S. E., McSweeney, C. S.(2015)“在瘤胃中替代甲烷生成的乙酸生成”。Malik, P. K. Bhatta, R. Takahashi, J., Kohn, R. A.和Prasad C. S(编),《畜牧业生产与气候变化》。CABI,沃林福德,牛津郡,英国
2.Malik, P. K., Bhatta, R., Gagen, E. J., Sejian, V., Soren, N. M., Prasad, C. S.(2015)“减少瘤胃甲烷生成的备选H2汇”在C.(编辑),气候变化对牲畜的影响:适应和缓解,施普林格,印度,第303-320页。

期刊文章
1.Paz, A., Gagen, E. J., Levett, A., Southam, G.(2021)压碎铁氧体上生长的生物外壳的铁化:斜坡稳定的潜力。矿石地质评价。5月17日接受。
2.Henne, A., crow, D., Gagen, E., Southam, G.(2021)澳大利亚昆士兰州硫化物Chalmers山矿山低铁水中金属的生物促进沉淀。矿石地质评价。5月16日接受。
3.Levett, A., Gagen, E. J., Paz, A., Vasconcelos, P., Southam, G.(2021)巴西铁矿的生物修复策略。《环境科学与技术评论》doi: 10.1080 / 10643389.2021.1896346
4.Vaughan, J., Tungpalan, K., Parbhakar-Fox, A., Weng, F., Gagen, E. J., Southam, G., van der Ent, A., Erskine, P., Gow, P., Valenta, R.(2021)试图堵住漏洞:从铀冶金工艺尾矿中回收稀土元素。JOM, 73卷,39-53。doi: 10.1007 / s11837 - 020 - 04451 - 7
5.Levett, A., Vasconcelos, P. M., Jones, M., Rintoul, L., Paz, A., Gagen, E. J., Southam, G.(2021)“在富含铁的duricrust中与微化石一起保存的钛流动性”《化学地质学》,559,119955。doi: 10.1016 / j.chemgeo.2020.119955
6.Gagen, E. J., Levett, A., Paz, A., Bostelmann, H., Valadares, R. B., Bitencourt, J. A., Gastauer, M., Nunes, G. L., Oliveira, G., Vasconcelos, P. M., Tyson, G. W., Southam, G.(2020)加速微生物铁循环促进铁矿石地区表面地壳再胶结作用。微生物生物技术。doi: 10.1111 / 1751 - 7915.13646
7.Levett, A., Gagen, E. J., Zhao, Y., Vasconcelos, P. M., Southam, G.,(2020)“实验规模人工边坡的生物胶结物稳定和富铁地壳的改造。”《国家科学学术学报》,117(31)卷,99 18347-18354
8.Islam, Z. F., Welsh, C., Bayly, K., Grinter, R., Southam, G., Gagen, E. J., Greening C.(2020)“一种广泛分布的氢化酶在细菌生长期间氧化大气中的H2”ISME J, doi:10.1038/s41396-020-0713-4
9.Levett, A., Gagen, E. J., Rintoul, L., Guagliardio, P., Diao, H., Vasconcelos, P. M., Southam, G.(2020)“氧化铁外壳微生物化石的特征”科学报告,第10卷,9889。doi: 10.1038 / s41598 - 020 - 66830 - z
10.Henne, A., crow, D., Gagen, E. J., Southam, G.(2020)“细菌介导的磁铁矿氧化的实验模拟和巴西Salobo IOCG矿山铁矾形成的观察”《应用地球化学》,第118卷,104628。doi: 10.1016 / j.apgeochem.2020.104628。
11.Levett, A., Vasconcelos, P. M., Gagen, E. J., Rintoul, L., Spier, C., Guagliardo, P., Paz, A., Southam, G.(2020)“红土铁质硬地壳中的微生物风化特征”《地球和行星科学快报》。538卷,116209页。doi: 10.1016 / j.epsl.2020.116209
12.Henne, A., crow, D., Gagen, E. J., Southam, G.(2020)“细菌诱导氧化富铁矿石中的铁硅酸盐对红土形成的贡献,Salobo IOCG矿山,巴西”《化学地质学》,第539卷,第119499页。doi: 10.1016 / j.chemgeo.2020.119499
13.Paz, A., Gagen, E. J., Levett, A., Zhao, Y., Kopittke, P. M., Southam, G.(2020)“生长在含铁硬锈(canga)上的植物根际铁氧化物的生物地球化学循环”,总环境科学,第713卷,doi:10.1016/j.s itotenv.2020.136637
14.Levett, A., Gagen, E.J., Vasconcelos, P.M., Zhao, Y., Paz, A., Southam, G.(2020)“铁的生物地球化学循环:水泥形成和退化土地稳定的意义”,《总环境科学》,第707卷,doi:10.1016/j.s itotenv.2019.136128
15.Gagen, E.J., Zaugg, J., Tyson, G.W., Southam, G.(2019)“端粒螺旋菌属α变形杆菌嗜中性成员的针ethite减少”微生物学前沿,doi:10.3389/fmicb.2019.02938
16.Tait, A. W., Gagen, E. J., Wilson, S. A. Tomkins, A. G, Southam, G.(2019),“岩石中微米尺度裂缝的真核定殖:使用来自澳大利亚纳拉伯平原的自然风化陨石的“微流体”实验”,《天体生物学》,doi:10.1089/ast.2019.2077
17.Levett, A., Gagen, E. J., Southam, G.(2019)。“小而强大:微生物为矿山修复和废物稳定提供了灵感”,《澳大利亚微生物学》,doi: 10.1071/MA19055
18.Henne, A, crow, D., Gagen, e.j., Southam, G.(2019),“细菌介导的表基因改变和铜在巴西Salobo IOCG矿床矿化岩石中的再分配。”《矿石地质评论》,doi:10.1016/j.oregeorev.2019.103210
19.Henne, A., Craw, D., Gagen, E. J., Southam, G.(2019)“细菌对巴西Salobo矿富铁尾矿中金属的储存和移动的影响”,总环境科学,doi:10.1016/j.s itotenv.2019.04.448
20.Gagen, E. J., Levett, A., Paz, A., Gastauer, M., Caldeira, C. F, Valadares, R. B., Bitencourt, J. A, Alves, R., Oliveira, G. O, Vasconcelos, P. M., Southam, G.(2019)“加拿大生态系统的生物地球化学过程:铁矿石抵御侵蚀和巴西铁duricrust恢复的重要性”《矿石地质评论》,doi:10.1016/ J. oregeorev.2019.03.013。
21.Gagen, E. J., Levett, A., Fortin, D., Shuster, J., Vasconcelos, P. M., Southam, G.(2018)“从一个高度风化的条带铁形成系统中积极形成铁氧化物的微生物多样性”《微生物与环境》,doi: 10.1264/jsme2.ME18019。
22.Levett。A., Paz, A., Gagen, E. J., Diao, H., Guargliado, P., Vasconcelos, P. M., Southam, G.(2018)“铝在保存有机和无机微生物生物特征中的作用。”《地球科学前沿》,doi:10.1016/j.gsf.2018.06.006。
23.Santini, T. & Gagen, E. J.(2018)《采矿环境的地质微生物学》,《澳大利亚微生物学》,doi: 10.1071/MA18010, pp 37-41。
24.Tait, A. W., Gagen, E. J., Wilson, S. A., Tomkins, A. G., Southam, G.(2017)《石质陨石的微生物种群:第一批殖民者的微生物学前沿的基质控制》,第8卷,1227。
25.Tait, a . W. Wilson, S. a . Tomkins, a . G, Gagen, E. J., Fallon, S. J. Southam, G.(2017)《陨石作为陆地微生物栖息地的评估:来自澳大利亚纳拉伯平原的结果,一个类似火星的地点。地球化学与宇宙化学学报,第215卷,第1-16页。
26.Raudsepp, M. J., Gagen, E. J., Golding, S. D., Tyson, G. W., Southam, G.(2017)“烟煤对产甲烷混合培养和纯培养的甲烷球菌和Methanosarcina的影响。《燃料》,205卷,60-70页。
27.Levett, A., Gagen, E. J., Shuster, J., Rintoul, L., Tobin, M., Vongsvivut, J., Bambery, K., Vasconcelos, P., Southam, G.(2016)“铁duricrust形成中生物地球化学过程的证据。《南美地球科学杂志》,第71卷,131-142页。
28.加根,E. J.,吉永,M. Y.,加西亚-普拉多,F.,汤姆,M.,辛里奇,K-U。(2016)“静相柯达热球菌的蛋白质组。古菌四醚脂类生物合成的意义。“古菌,doi: 10.1155/2016/5938289。
29.M. Raudsepp, Gagen, E. J., Evans, P., Tyson, G., Golding, S. Southam。G.(2016)《水文地质扰动和开采对煤层气微生物群落的影响》,《地球生物学》,vol 14, pp163-175。
30.Zammit, C. M., Shuster, J. P., Gagen, E. J., Southam, G.(2015)“表基因金属矿床的地质微生物学”元素,vol 11 (5), pp 337-342。
31.Gagen, E. J., Padmanabha, J., Denman S. E., McSweeney, C. S.(2015)“氢基因营养培养富集揭示了牧场饲养牛的瘤胃Lachnospiraceae和Ruminococcaceae的acetogen和氢敏感拟杆菌门。”《FEMS微生物学快报》,第362卷(14)。doi: 10.1093 / femsle / fnv104。
32.吉永,M. Y.*,加根,E. J.*, Wörmer, L., Broda, n.k., Meador, T. B., Wendt, J., Thomm, M. & Hinrichs, K- u。(2015)“甲烷热杆菌(Methanothermobacter thermautotrophicus)调节膜脂以响应氢和营养物质的可利用性”,微生物学前沿,doi: 10.3389/fmicb.2015.00005 *等贡献。
33.Gagen, E. J., Wang, J., Padmanabha, J., Liu, J., Carvalho de Carvalho, i.p ., Liu, J., Webb, R. I., Al Jassim, R., Morrison, M. Denman, S. E., McSweeney, c.s .(2014)“从沙袋鼠前胃的浓缩中分离出的一种新乙酰原生长能力的调查。”《BMC微生物学》第14卷第314页。
34.艾林,F. J.,柯恩内克,M.,利普,J. S.,贝克K. W.,加根,E. J.,辛里奇斯,K-U。(2014)“生长阶段对海洋亚硝基藻(thumarchaeon Nitrosopumilus maritimus)膜脂组成的影响及其对海洋环境中古细菌脂质分布的影响”,《地球化学与宇宙化学学报》,第141卷,第579-597页。
35.Meador, t.b. *, Gagen, e.j. *, Loscar, m.e, Goldhammer, T., Yoshinaga, m.y ., Wendt, J., Thomm, M., Hinrichs, K-U(2014)“在控制和磷酸盐还原条件下对柯达热球菌进行完整的极性脂质分析。”微生物学前沿,doi: 10.3389/fmicb.2014.00010 *同等贡献。
36.加根,E. J., Huber, H., Meador, T., Hinrichs, K-U。,Thomm, M., (2013) ‘A novel cultivation-based approach for understanding the Miscellaneous Crenarchaeotic Group (MCG) Archaea from sedimentary ecosystems’ Applied and Environmental Microbiology, vol 79 (20), pp. 6400-6406.
37.Gagen, E. J., Mosoni, P., Denman, S. E., Al Jassim, R., McSweeney, C. S.和Forano, E.(2012)“产甲烷菌定植不会显著改变出生后17小时分离并无菌饲养的羔羊的acetogen多样性”,《微生物生态学》,第64卷(3),628-640页。
38.Gagen, E. J., Denman S. E., Padmanabha, J., Al Jassim, R., McSweeney, C. S.(2010)“功能基因分析表明牛瘤胃和沙袋鼠前胃中存在不同的乙酰菌群”,《应用与环境微生物学》,第76卷(23),7785-7795页。

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